Cục Thuế vừa ban hành hướng dẫn nhằm thống nhất việc thực hiện các quy định của Luật Quản lý thuế số 108/2025/QH15, Nghị định số 252/2026/NĐ-CP của Chính phủ và Thông tư số 90/2026/TT-BTC của Bộ Tài chính về đăng ký thuế đối với chi nhánh, văn phòng đại diện của doanh nghiệp nước ngoài thuộc diện đăng ký trực tiếp với cơ quan Thuế.
Theo Công văn số 4937/CT-NVT gửi các cơ quan thuế địa phương, chi nhánh hoặc văn phòng đại diện khi thực hiện đăng ký thuế lần đầu phải nộp hồ sơ trong thời hạn 10 ngày làm việc kể từ ngày được cơ quan có thẩm quyền tại Việt Nam cấp giấy phép thành lập và hoạt động hoặc văn bản có giá trị pháp lý tương đương.
Hồ sơ đăng ký bao gồm tờ khai đăng ký thuế theo Mẫu 01-ĐKT, các phụ lục, bảng kê theo quy định và bản sao giấy phép thành lập, hoạt động. Toàn bộ hồ sơ được thực hiện chủ yếu bằng phương thức điện tử thông qua Cổng Dịch vụ công quốc gia, Ứng dụng định danh quốc gia hoặc Hệ thống thông tin quản lý thuế. Cơ quan tiếp nhận là cơ quan thuế cấp tỉnh nơi chi nhánh hoặc văn phòng đại diện đặt trụ sở.
Một điểm đáng lưu ý là người nộp thuế phải kê khai đầy đủ thông tin về công ty mẹ ở nước ngoài, đồng thời nộp kèm Bảng kê chủ sở hữu pháp lý và chủ sở hữu hưởng lợi theo Mẫu BK07-ĐKT.
Theo hướng dẫn, chủ sở hữu pháp lý là cá nhân hoặc tổ chức đứng tên sở hữu phần vốn hoặc quyền sở hữu tương đương theo quy định của pháp luật tại quốc gia nơi doanh nghiệp được thành lập. Trong khi đó, chủ sở hữu hưởng lợi được xác định căn cứ theo quy định của pháp luật về phòng, chống rửa tiền và các quy định của pháp luật doanh nghiệp có liên quan.
Đối với việc điều chỉnh thông tin đăng ký thuế, người nộp thuế phải hoàn thành thủ tục trong thời hạn 10 ngày làm việc kể từ ngày phát sinh thay đổi. Riêng các chi nhánh, văn phòng đại diện đã được cấp mã số thuế trước ngày 1/7/2026 phải bổ sung Bảng kê BK07-ĐKT khi thực hiện thủ tục thay đổi thông tin đăng ký thuế.
Nếu việc thay đổi địa chỉ trụ sở làm thay đổi cơ quan thuế quản lý, doanh nghiệp phải thực hiện đầy đủ thủ tục tại cả cơ quan thuế nơi chuyển đi và nơi chuyển đến theo đúng trình tự và thời hạn quy định. Các thủ tục này cũng được thực hiện chủ yếu bằng hình thức điện tử.
Ngoài nội dung về đăng ký và thay đổi thông tin, văn bản còn hướng dẫn quy trình đối với các trường hợp tạm ngừng hoạt động, hoạt động trở lại trước thời hạn, chấm dứt hiệu lực mã số thuế và khôi phục mã số thuế.
Đối với các thủ tục nêu trên, hồ sơ được ưu tiên nộp trực tuyến qua Cổng Dịch vụ công quốc gia, Ứng dụng định danh quốc gia hoặc Hệ thống thông tin quản lý thuế. Trường hợp không thể thực hiện bằng phương thức điện tử, người nộp thuế vẫn có thể nộp hồ sơ trực tiếp hoặc gửi qua dịch vụ bưu chính công ích.
Cục Thuế cũng yêu cầu các chi nhánh và văn phòng đại diện của doanh nghiệp nước ngoài phải thường xuyên cập nhật, kê khai đầy đủ thông tin về chủ sở hữu pháp lý và chủ sở hữu hưởng lợi của công ty mẹ ngay từ khi đăng ký thuế lần đầu cũng như mỗi khi có thay đổi thông tin.
Bên cạnh đó, doanh nghiệp có trách nhiệm lưu giữ đầy đủ hồ sơ, tài liệu liên quan trong thời gian tối thiểu 5 năm để phục vụ công tác quản lý, thanh tra và kiểm tra của cơ quan thuế.
Việc bổ sung quy định về kê khai chủ sở hữu pháp lý và chủ sở hữu hưởng lợi được đánh giá là giải pháp góp phần nâng cao tính minh bạch trong quản lý thuế đối với doanh nghiệp có vốn và yếu tố nước ngoài, đồng thời đáp ứng yêu cầu về phòng, chống rửa tiền, phù hợp với xu hướng tăng cường quản lý thuế trong quá trình hội nhập kinh tế quốc tế.
